Mysticeti (ballenas con ballenas):

Tienen láminas córneas y elásticas en su mandíbula superior que semejan un bigote y poseen dos arventadorespor los cuajes respiran. Los animales pertenecientes a este suborden son conocidos como verdaderas ballenas y el nombre ballena tamnién se dio a esas láminas corneas que tienen en la mandíbula superior.

Odonteceti (ballenas con dientes):

Están provistos de dientes, generalmente homodontos—iguales—, cráneo asimétrico y un solo orificio nasal.

La ballena azul, Balaenoptera musculus.

Pertenece a la familia Balaenopteridae y es el mamífero más grande que habita en la Tierra. Llega a medir hasta 30 metros y pesa alrededor de 100 toneladas.

Habita todos los océanos del mundo y generalmente se la encuentra a lo largo de la plataforma continental. En el Pacífico oriental tropical se han identificado dos áreas, principalmente durante el invierno y la primavera, una es la denominada "domo de Costa Rica" y la otra se encuentra en las costas de la Península de Baja California. En el Golfo de México esta especie es muy rara.

La ballena franca, Eubalaena glacialis.

Pertenece a la familia Balaenidae. Llega a medir alrededor de 17 metros y pesa unas 70 toneladas. Se encuentra en las aguas templadas y frías del hemisferio Norte y se han encontrado, esporádicamente, algunos individuos en las regiones subtropicales. Durante los meses de febrero a abril se la puede localizar en la costa noroccidental de la Península de Baja California, hasta la altura de Los Cabos. En el Golfo de México sólo se la ha visto en la costa occidental de Florida y en la costa de Texas.

La ballena gris, Eschrichtius robustus.

Pertenece a la familia Eschrichtidae. Puede alcanzar unos 15 metros de longitud y pesar alrededor de 30 toneladas. Como su nombre lo indica la coloración de su piel es de un tono gris, con algunas manchas o medias lunas principalmente en el dorso.

Solamente se la puede encontrar en el Pacífico Norte y está representada por dos poblaciones: la casi extinta población asiática y la numerosa población americana. Esta última realiza migraciones siguiendo la línea de la costa desde los mares de Behring, Chukchi y Beaufort, donde se alimenta durante el verano, hasta de la Península de Baja California y el Golfo de California. Se concentra principalmente en las lagunas Ojo de liebre, San Ignacio y el complejo lagunar de Bahía Magdalena, de diciembre a abril. En el Golfo de California se pueden encontrar, principalmente, en el área de Yavaros, Sonora, y en la bahía de Santa María en Sinaloa.

La ballena jorobada, Megaptera novaeangliae.

Pertenece a la familia Balaenopteridae. Puede tener una longitud de hasta unos 17 metros y alcanzar un peso de hasta 45 toneladas. Habita en todos los océanos. En el Pacífico oriental tropical se localiza una de las zonas de agregación invernal, dentro de la cual, a su vez, se pueden distinguir tres concentraciones discretas: la del archipiélago de Revillagigedo; la de la costa continental, desde la altura de Mazatlán, Sinaloa, hasta el Golfo de Panamá; y la de las aguas adyacentes al extremo sur de la Península de Baja California. En estas áreas se la puede observar desde noviembre hasta mayo, con un pico de abundancia en los meses de febrero y marzo. En el Golfo de California, en su región norte y de las Grandes Islas, existen algunos registros de esta especie durante las cuatro estaciones del año, lo que indica que algunas ballenas jorobadas permanecen dentro del golfo y no realizan la migración "normal" hacia las aguas frías del Pacífico Norte. Actualmente, la principal área invernal de distribución de las ballenas jorobadas del Atlántico occidental es el Mar Caribe, sin embargo, antes de que la población fuera drásticamente reducida, el Golfo de México debió haber sido parte de su área de distribución invernal.

Rorcual común, Balaenoptera physalus.

Pertenece a la familia Balaenopteridae. Alcanza unos 25 metros de longitud y llega a pesar hasta 65 toneladas. El rorcual común habita todos los mares del mundo pero son muy raros en aguas tropicales. En el Pacífico oriental tropical sólo se conoce su presencia en aguas oceánicas muy lejanas a la costa. Su relación con la población del Pacífico norte no se ha estudiado. Aunque se tienen numerosos registros de estas ballenas durante todo el año, son más abundantes durante el invierno y la primavera, principalmente en la región de las Grandes Islas (Canal de Ballenas, Canal de Salsipuedes, Puerto, Libertad) y en la costa suroccidental del Golfo de California. En el Golfo de México sólo se la ha visto escasamente a largo del año, por lo que se cree que existe una población aislada, en forma similar a lo que sucede en el Golfo de California.

Rorcual de Minke, Balaenoptera acutorostrata.

Pertenece a la familia Balaenopteridae. Es una de las ballenas verdaderas más pequeñas pues alcanza alrededor de los 10 metros de longitud y pesa hasta 10 toneladas. Esta especie se encuentra en todos los océanos del mundo, tiene una marcada preferencia por aguas templadas y frías y es poco frecuente en aguas tropicales. En el Pacífico oriental tropical no se tienen registros de esta especie. En el Golfo de California se le ha visto por la Bahía de San Luis Gonzaga del Golfo de Santa Clara, cerca de San Felipe, por las islas San Pedro Mártir y del Carmen y por la región central del Golfo. En el Golfo de México se la ha encontrado en la costa norte durante los meses de invierno y primavera.

Rorcual de sei, Balenoptera borealis.

Pertenece a la familia Balaenopteridae. Llaga a medir alrededor de 16 metros y pesa alrededor de 20 toneladas. Estas ballenas habitan principalmente aguas frías y templadas fuera de la plataforma continental. En el Pacífico oriental se distribuyen durante el invierno por lo menos hasta el archipiélago de Revillagigedo. En el Golfo de California sólo se las ha visto en temporada de invierno al norte de la Isla del Carmen, cerca de Los Islotes en la bahía de La Paz y en la bahía de Banderas, Nayarit. En el Golfo de México se tienen registros de su presencia en las costas de Mississippi y Louisiana en el norte, y Campeche en el sur.

Rorcual tropical, Balaenoptera edeni.

Pertenece a la familia Balaenopteridae. Esta especie se caracteriza por habitar exclusivamente aguas tropicales y subtropicales. En el Pacífico Oriental tropical se distribuyen ampliamente tanto cerca como lejos de la costa. En la costa occidental de la península de Baja California se pueden observar particularmente en las aguas cercanas a la Bahía Magdalena. En el Golfo de California es frecuente encontrarla, especialmente durante el verano y otoño, en la región de las Grandes Islas, especialmente en Canal de Ballenas, en las aguas cercanas a Loreto y en la bahía de La Paz. En el Golfo de México se encuentra en la costa nororiental del Golfo, y es la población más estudiada. Debido sus hábitos de vivir en aguas tropicales se piensa que estas ballenas son la especie más común en el Golfo de México.